Outre la partie centrale du cerveau (cerveau), une autre partie clé du cerveau est le tronc cérébral qui relie le cerveau principal et la moelle épinière humaine. Le tronc cérébral est principalement responsable de l’ouïe, la marche, se mettre debout, la vision et la modulation de la fréquence cardiaque. Il est rare que les cancers de l’enfant affectent le tronc cérébral, mais lorsque c’est le cas, ils délimitent un enfant pendant un temps très long. 
Les tumeurs du tronc cérébral s’étendent sur près de deux ans entre le diagnostic chez un enfant et le traitement complet. Cependant, une tumeur provenant de la moelle épinière ou du cerveau principal est appelée une tumeur primaire. Ils sont généralement plus faciles à guérir complètement que celles originaires ailleurs et éventuellement propageant vers le cerveau. Les tumeurs provenant d’ailleurs, mais propageant au cerveau sont médicalement dénommées les tumeurs métastatiques.
Les tumeurs développées à l’intérieur du cervelet sont connues comme des tumeurs rhomboïdes et peuvent se propager à d’autres parties du cerveau comme le tronc cérébral ou la moelle épinière. Dans ce cas, elles sont considérées comme un type peu différencié. Un exemple est la tumeur des astrocytomes qui se produit dans les cellules primitives du corps connues comme les astrocytes. Elles sont généralement des tumeurs malignes en croissance rapide, peu différenciées, dans les cancers chez les enfants. Cependant, si elles accroissent bien différenciées, elles ne se propagent pas rapidement et semblent tout à fait normales sous un microscope optique.
La plupart des cas de tumeurs du tronc cérébral sont faciles à détecter chez les enfants car elles sont habituellement détectées par les techniques d’imagerie qui sont très précises dans les zones pas trop cachée de la surface. Enfin, l’embryon de l’enfant peut développer des tumeurs communément appelées SNC ou des tumeurs embryonnaires SNC. Cela se produit dans les cellules du cerveau lorsque le fœtus est en fait dans ses tous premiers stades de développement. Les tumeurs embryonnaires SNC sont de cinq sortes, à savoir : L’Ependymoblastome, le Pinéoblastome, le médulloépithéliome, le médulloblastome et les tumeurs pinéales.
